Le management de l’entreprise ou de l’organisme dont le coeur de métier est l'ingénierie système, s’appuie sur un ensemble de processus appelés processus d’entreprise qui ont un double rôle de management des domaines communs aux différents projets et d’aide à la décision pour le management de l’organisme.
Ce sont, en se référant à la norme ISO 15288 :
- le processus de management de l’environnement de l’entreprise d’IS pour l’obtention et la conduite des affaires,
- le processus de management de l’investissement sur les programmes de l’entreprise et communs aux différents projets,
- le processus de management des ressources, compétences humaines et moyens techniques, tant en termes d'acquisition et de développement qu'en termes d'allocation aux projets,
- le processus de management de la qualité,
- le processus de management des processus institutionnalisés dans l’entreprise (ingénierie, déploiement, amélioration des processus standard).
On note que ces processus d’entreprise concourent à la constitution et au développement du potentiel de l’entreprise au profit de ses projets.