Les principes généraux du management de projet tels que formalisés dans la norme ISO 10006 (ou dans le PM-BOK, Project Management, Book of knowledge, du Project Management Institute) s’appliquent au projet d’IS.
Le management d’un projet y est décrit comme un processus générique comprenant les activités de planification et celles de conduite comprenant le suivi (évaluation des écarts par rapport au plan) et la maîtrise (réaction à ces écarts). Ce processus générique est appliqué aux différents domaines du management de projet : coordination globale, management du contenu (les tâches), des coûts, des délais, des moyens, de la qualité, des ressources humaines, des risques, de l’information, de la communication et des sous-traitances.
A un niveau opératoire, le management s'appuie sur les processus et leurs activités. Il s'agit de plannifier, suivre et maîtriser les tâches techniques du projet, sachant que ces tâches sont définies à partir des éléments du système à réaliser et des activités des processus pour les réaliser et sont allouées aux éléments de l'organisation qui en assurent la réalisation. Ingénierie système et management de projet y sont intimement mélés : C'est le rôle de l'ingénierie d'identifier les activités nécessaires à l'obtention des livrables, d'en déduire les tâches, de les estimer et de les ordonnancer puis de les coordonner et d'en suivre les résultats, c'est le rôle du management de projet de les planifier et de les attribuer aux éléments de l'organisation en allouant et gérant les ressources, puis de suivre l'exécution du plan, les actions de maîtrise devant être conçues et analysées en commun.
A un niveau plus stratégique, le management est jalonné par les phases du cycle de vie du projet : les décisions de poursuite, de réorientation ou d’arrêt du projet sont prises, lors de ces jalons, en fonction de l’évolution de l’environnement et des objectifs du projet d’une part, de l’avancement et des risques du projet évalués lors de revues de projet d’autre part.
Ce domaine du management de projets étant maintenant assez formalisé et couvert par des organismes spécialisés tel que le PMI (Project Management Institute) ou l’AFITEP en France, l’AFIS se focalise, via le comité technique Management de l'IS, sur les aspects spécifiques à son métier : relation entre ingénierie système et management de projet, management des projets indusrtriels et relations entre maîtres d'ouvrages, maîtres d'oeuvres, sous-traitants et équipementiers, management des programmes impliquant de nombreux projets, management des lignes de produits, etc.
Notons que les normes d’IS (IEEE 1220, EIA 632, ISO 15288) précisent les activités spécifiques à l'IS pour piloter des tâches des autres processus (techniques, de support, contractuels) des projets dans les domaines de l’IS.